В 2035 году в результате научного эксперимента произошла катастрофа, которая привела к появлению искусственной формы жизни под названием "Материя". Родители главной героини Айко Тачибаны погибли во время "Взрыва". Два года спустя, благодаря встрече с парнем по имени Юя Кандзаки, она приближается к тайне, которая стоит за трагедией... Другие названия: A.I.C.O.: Incarnation